在線總氮監測儀是基于國家標準方法堿性過硫酸鉀分光光度法研發的全自動在線分析儀器，它的測試結果取決于提交的樣本。因此在在線總氮監測儀的使用過程中，收集具有代表性的水樣非常重要。除了水樣收集，在線總氮監測儀使用過程中還會存在哪些問題呢？ 

首先是一些在線總氮監測儀的運行可靠性難以保證，在使用時已經調試校正，卻仍然存在誤差，會影響顯示數值的準確性，從而使得監控人員難以判斷。其次是目前在線總氮監測儀配置的基本上是進口儀表，國內從事在線監測成套設備生產的廠家并不多，因此維護保養費用會偏高，尤其是配件，同時對維護人員的操作技能的要求也相對會比較高。

在在線總氮監測儀使用過程中，大部分儀表直接或間接與污水接觸，對儀表的清沽工作提出了較高的要求，沒有定期清潔保養的儀表在長期運行過程中常常會產生測量誤差，影響檢測結果。有些污水廠的監測系統儀器配置還達不到高層次系統自控要求，如儀器數量不足，現有儀器設備的配備功能不夠等，需要人工巡查以方大監控運行的保險系數。